种属不同
花甲属帘蛤目、帘蛤科、蛤仔属；蚬子是双壳纲的 1科，代表属蚬属动物壳小型到中型。
外形不同
花甲长约3厘米，壳卵圆形，个头较小，贝壳表面颜色一般为黄褐色，壳面暗纹有凹凸感，颜色深暗，花纹变大，有黑色、棕色、深褐色、密集色或赤褐色组成的斑点或花纹；蚬子外形圆形或近三角形，壳面光泽，具有同心圆的轮脉，黄褐色或棕褐色，壳内面白色或青紫色。
颜色不同
花甲贝壳表面颜色般为黄褐色，壳面有黑色、棕色、深褐色、密集色或赤褐色组成的斑点或花纹；蚬子壳面呈黄绿色、黑褐色和黑色，有光泽。
生活习性不同
花甲生于潮间带下数米深的浅海区，以泥沙海底为最多；蚬子生长于淡水水域内。
产地不同
花甲广泛分布在中国南北海区、韩国和日本；蚬子广泛分布于除南极洲外的各大洲水域。
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